La collezione di Minerali greggi e lavorati della Miniera e Fonderia del Bottino, nell'odierno allestimento, descrive e riassume le fasi metallurgiche di estrazione dei metalli Piombo e Argento a partire dai minerali coltivati Galena e Blenda (oggi detta Sfalerite).
In tal senso documenta la forte vocazione mineraria della Toscana, connessa con le peculiari situazioni geologiche della regione.
La collezione del Museo di Storia Naturale dell’Accademia dei Fisiocritici ha quindi un alto valore storico e antropologico, oltre che scientifico.
Raccolte come questa rappresentano infatti un legame tangibile con una cultura mineraria che risale almeno all’epoca etrusca e una testimonianza unica del patrimonio scientifico e dei processi dell'industria metallurgica, oggi pressoché scomparsi.
Il Museo di Storia Naturale dell’Accademia dei Fisiocritici conserva una decina di collezioni con caratteristiche analoghe.